সম্প্রতি প্রকাশিত এক গবেষণায় ড প্রাকৃতিক ঔষধ, গবেষকরা স্তন ক্যান্সারের ঝুঁকিতে জেনেটিক বংশের ভূমিকা ব্যাখ্যা করার জন্য স্বাস্থ্যকর স্তন টিস্যুতে উপস্থিত বিভিন্ন কোষের প্রকারগুলি ম্যাপ করেছেন।
অধ্যয়ন: একক-নিউক্লিয়াস ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি এবং নারী স্তনের টিস্যুর ট্রান্সক্রিপ্টোমিক মানচিত্র বৈচিত্র্যময় জেনেটিক পূর্বপুরুষের সাথে। ইমেজ ক্রেডিট: Motortion Films/Shutterstock.com
স্তন ক্যান্সারে জেনেটিক বংশের ভূমিকা
একাধিক কারণ স্তন ক্যান্সারের ফলাফলে বৈষম্যের জন্য অবদান রাখে, যার মধ্যে রয়েছে আর্থ-সামাজিক অবস্থা, স্বাস্থ্যসেবার অ্যাক্সেস এবং জেনেটিক বংশ। সাম্প্রতিক গবেষণায় দেখা গেছে যে জিনগত পূর্বপুরুষ জিনোম গঠন এবং ক্যান্সার জিন মিউটেশন প্যাটার্নকে প্রভাবিত করতে পারে। এর মধ্যে বিভিন্ন জেনেটিক বংশধরের ব্যক্তিদের মধ্যে ক্যান্সারে পরিলক্ষিত জেনেটিক মিউটেশনের ধরন এবং ফ্রিকোয়েন্সি এবং সেইসাথে ক্যান্সারের বিকাশের সময় ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসযোগ্যতার পরিবর্তন অন্তর্ভুক্ত থাকতে পারে।
বর্তমান গবেষণায় গবেষকরা পূর্বে সুস্থ দাতাদের কাছ থেকে প্রাপ্ত স্তনের টিস্যু বায়োপসিতে উপস্থিত 23টি ভিন্ন উপপিথেলিয়াল অবস্থা বর্ণনা করেছেন। এই অগ্রগতি সত্ত্বেও, জেনেটিক বংশ কীভাবে স্তন টিস্যু কোষগুলির অবস্থা বা অবস্থাকে প্রভাবিত করে এবং ক্যান্সার প্রক্রিয়ার উপর তাদের পরবর্তী প্রভাবকে প্রভাবিত করে তা এখনও অস্পষ্ট।
অধ্যয়ন সম্পর্কে
কোমেন টিস্যু ব্যাঙ্কটি ভিন্নধর্মী জেনেটিক উত্সের 92 জন মহিলার কাছ থেকে প্রাপ্ত স্তনের টিস্যু নমুনাগুলি মূল্যায়ন করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। ডিঅক্সিরাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড (ডিএনএ) এছাড়াও দাতার রক্ত থেকে বিচ্ছিন্ন এবং জেনেটিক বংশগতি ম্যাপিংয়ের জন্য ব্যবহৃত হয়।
স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোমিক্স গবেষকদের ডাক্টাল এবং লোবুলার এপিথেলিয়াল কোষের মধ্যে জিনের অভিব্যক্তিতে পার্থক্য অধ্যয়ন করতে সক্ষম করে। দুটি কোষের মধ্যে উপস্থিত জিনের অভিব্যক্তি পার্থক্য সনাক্ত করতে স্থানিক ট্রান্সক্রিপ্টোমিক ডেটার সাথে এপিথেলিয়াল সেল জিন এক্সপ্রেশন স্বাক্ষরগুলিকে একত্রিত করা এবং ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি ডেটার সাথে এই পার্থক্যগুলিকে একীভূত করা।
একক-নিউক্লিয়াস অ্যাসে ট্রান্সপোসেজ ক্রোমাটিন বিশ্লেষণকে একক-নিউক্লিয়াস রাইবোনিউক্লিক অ্যাসিড সিকোয়েন্সিং (snRNA-seq) আফ্রিকান এবং ইউরোপীয় ব্যক্তি সহ বিভিন্ন বংশের তথ্যের সাথে একত্রিত করে। snRNA-seq এবং একক-নিউক্লিয়াস ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি (snATAC)-seq ডেটা একত্রিত করুন জেনেটিক বংশধর জুড়ে কোষের ধরন এবং রাজ্যগুলি সনাক্ত করতে।
ইন্টিগ্রিন α6 (CD49f) এবং এপিথেলিয়াল সেল আনুগত্য অণু (EpCAM) এক্সপ্রেশনটি এপিথেলিয়াল কোষের প্রকারগুলিকে বেসাল কোষ, লুমিনাল প্রোজেনিটর কোষ এবং পরিপক্ক লুমিনাল কোষগুলিতে শ্রেণীবদ্ধ করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। সমস্ত কোষের মধ্যে ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন (DEGs) জেনেটিক বংশের প্রেক্ষাপটে চিহ্নিত এবং বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।
SCENIC-এর মতো কম্পিউটেশনাল টুলগুলি জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কগুলি অনুমান করতে ব্যবহৃত হয়, যখন সিগন্যাইক নির্দিষ্ট কোষের প্রকারে সমৃদ্ধ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইট মোটিফগুলি সনাক্ত করতে ডিএনএ মোটিফ বিশ্লেষণের জন্য ব্যবহৃত হয়।
সুস্থ স্তনে নিয়ন্ত্রক প্রক্রিয়ার ভূমিকা ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি ম্যাপিং এবং জিন এক্সপ্রেশন ডেটার মাধ্যমেও নির্ধারিত হয়, যা ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর 1 (ESR1), ফর্কহেড বক্স A1 (FOXA1) এবং লুমিনাল হরমোন সেন্সিং GATA বাইন্ডিং প্রোটিন 3 (GATA3) এর উপর ফোকাস করে (LHS) কোষ।
এলএইচএস, লুমেন-অ্যাডাপ্টেড সিক্রেটরি প্রিকারসার (এলএএসপি), এবং বেসাল মায়োপিথেলিয়াল (বিএম) কোষগুলিও এলএএসপি কোষের ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি 1, 12 এবং 18-এর সাথে নেটিভ আমেরিকান-সমৃদ্ধ ক্লাস্টারে জিনের অভিব্যক্তির তুলনা করে .
গবেষণা ফলাফল
স্তনের টিস্যুর নমুনাগুলিতে মোট দশটি ভিন্ন কোষের ধরন সনাক্ত করা হয়েছিল, যার মধ্যে কয়েকটিতে এপিথেলিয়াল কোষ, এন্ডোথেলিয়াল কোষ, অ্যাডিপোসাইটস, ফাইব্রোব্লাস্টস, টি কোষ এবং ম্যাক্রোফেজ অন্তর্ভুক্ত ছিল। ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি, জিন এক্সপ্রেশন এবং ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটরগুলির উপর ভিত্তি করে তিনটি এপিথেলিয়াল সাব-টাইপগুলিতে সমৃদ্ধ কিছু চিহ্নিতকারী সহ বিভিন্ন কোষের ধরণের সমৃদ্ধ জিনের মধ্যে উল্লেখযোগ্য ওভারল্যাপ পরিলক্ষিত হয়েছিল।
71টি জিন নিয়ন্ত্রক নেটওয়ার্কের মধ্যে, 66টি এপিথেলিয়াল কোষের তিনটি উপপ্রকারের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা ছিল। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর (TF)-বাইন্ডিং মোটিফগুলি প্রতিটি কোষের প্রকারে ক্রোমাটিনের অ্যাক্সেসযোগ্য অঞ্চলে প্রচুর পরিমাণে থাকে।
ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর (ইআর) বাইন্ডিং সাইটগুলি এলএএসপি এবং এলএইচএস কোষে ক্রোমাটিনের অ্যাক্সেসযোগ্য অঞ্চলে অবস্থিত, তবে বিএম কোষে কম সাইট রয়েছে। এই পর্যবেক্ষণটি গুরুত্বপূর্ণ কারণ এই কোষগুলিতে ER বাইন্ডিং সাইটগুলির উপস্থিতি ইস্ট্রোজেন রিসেপ্টর-পজিটিভ (ER+) স্তন ক্যান্সারের জন্য উত্সের কোষ হিসাবে তাদের ভূমিকা নির্দেশ করতে পারে।
নির্দিষ্ট মার্কারগুলি ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি, জিন এক্সপ্রেশন এবং ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটরগুলির সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ বলে পাওয়া গেছে যা বিএম, এলএইচএস এবং এলএএসপি স্তন্যপায়ী এপিথেলিয়াল কোষগুলিকে আলাদা করে। LHS কোষের জেনেটিক স্বাক্ষর লুমিনাল A, Luminal B এবং হিউম্যান এপিডার্মাল গ্রোথ ফ্যাক্টর রিসেপ্টর 2 (HER2+) স্তন ক্যান্সারের উপপ্রকারে সমৃদ্ধ হয়, এইভাবে প্রায় 80% স্তন ক্যান্সারে LHS কোষকে জড়িত করে।
বিপাকীয় পথগুলি নালী কোষগুলিতে প্রচুর পরিমাণে থাকে, যেখানে মাইটোজেন-অ্যাক্টিভেটেড প্রোটিন কিনেস (MAPK) পথগুলি লোবুলার এপিথেলিয়াল কোষগুলিতে প্রচুর থাকে। এই পর্যবেক্ষণটি স্তন নালী এবং লোবিউলের স্বাভাবিক এপিথেলিয়াল কোষের মধ্যে জৈবিক পার্থক্যের পরামর্শ দেয়।
নেটিভ আমেরিকানদের অ্যালভিওলার প্রোজেনিটর কোষ এবং আফ্রিকান মহিলাদের স্ট্রোমাল ফাইব্রোব্লাস্টগুলিতে উল্লেখযোগ্য জেনেটিক বৈচিত্র লক্ষ্য করা গেছে। নেটিভ আমেরিকান স্তন টিস্যুর নমুনাগুলি উচ্চতর ESR1 স্তর প্রদর্শন করে, যা তাদের স্তন টিস্যুতে ইস্ট্রোজেন সংকেতকে প্রভাবিত করতে পারে এবং তাই অন্যান্য বংশের মহিলাদের তুলনায় তাদের ER+ স্তন ক্যান্সারের সংবেদনশীলতা বৃদ্ধি করে।
বিপরীতে, আফ্রিকান মহিলাদের স্তনের টিস্যুতে আরও প্রচুর পরিমাণে ফাইব্রোব্লাস্ট সাব-টাইপ দেখা যায় যা বৃদ্ধির কারণ, সাইটোকাইনস এবং এক্সট্রা সেলুলার ম্যাট্রিক্স উপাদানগুলির নিঃসরণ প্রচার করে টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টকে উল্লেখযোগ্যভাবে প্রভাবিত করতে পারে যা ক্যান্সারের আক্রমণ এবং বিস্তারে অবদান রাখতে পারে। স্থানান্তর.
এই সম্ভাব্য প্রো-টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টের আবিষ্কার ব্যাখ্যা করতে পারে কেন আফ্রিকান মহিলারা ট্রিপল-নেগেটিভ স্তন ক্যান্সার (TNBC) এর মতো আরও আক্রমনাত্মক স্তন ক্যান্সার হওয়ার ঝুঁকিতে বেশি।
প্রভাব
ফলাফলগুলি স্বাস্থ্যকর স্তন টিস্যুর জীববিজ্ঞানে জেনেটিক বংশের ভূমিকা এবং কীভাবে কোষের ধরন এবং কোষগুলির এই বৈচিত্রগুলি গুরুত্বপূর্ণ অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করতে পারে সে সম্পর্কে গুরুত্বপূর্ণ অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে। বায়োমার্কার অভিব্যক্তি প্রভাবিত করতে পারে স্তন ক্যান্সারের ঝুঁকি নির্দিষ্ট রোগীর গ্রুপে।
বিভিন্ন বংশের মহিলাদের মধ্যে স্তনের টিস্যুর এই জৈবিক পার্থক্যগুলি ব্যক্তিগতকৃত ওষুধের গুরুত্বের উপর জোর দেয় যা বিভিন্ন জাতিগত পটভূমির মহিলাদের নির্দিষ্ট চাহিদাগুলিকে মোকাবেলা করতে পারে এবং শেষ পর্যন্ত রোগীর ফলাফল উন্নত করতে পারে।
জার্নাল রেফারেন্স:
- ভাট-নক্ষত্রী, পি., গাও, এইচ., খাটপে, এএস, ইত্যাদি. (2024)। একক-নিউক্লিয়াস ক্রোমাটিন অ্যাক্সেসিবিলিটি এবং নারী স্তনের টিস্যুর ট্রান্সক্রিপ্টোমিক মানচিত্র বৈচিত্র্যময় জেনেটিক পূর্বপুরুষের সাথে। প্রাকৃতিক ঔষধ. নম্বর: 10.1038/s41591-024-03011-9