নতুন জিনোমিক প্রযুক্তি সংক্রমণ ব্যবস্থাপনা দ্রুত করতে হাসপাতালে সুপারবাগ ট্র্যাক করে

গবেষকরা একটি নতুন জিনোমিক প্রযুক্তি তৈরি করেছেন যা একই সাথে হাসপাতালে একাধিক সুপারবাগের বিস্তারকে ট্র্যাক করতে পারে, যা সাধারণ হাসপাতালের সংক্রমণ প্রতিরোধ ও পরিচালনা করতে সাহায্য করতে পারে আগের চেয়ে দ্রুত এবং আরও কার্যকরভাবে।

ওয়েলকাম স্যাঞ্জার ইনস্টিটিউট, ইউনিভার্সিটি অফ ওসলো, ইতালির IRCCS পলিক্লিনিকো সান ম্যাটিও ফাউন্ডেশন এবং সহযোগীদের দ্বারা পরিচালিত এই প্রুফ-অফ-কনসেপ্ট অধ্যয়নটি একটি নতুন ডিপ সিকোয়েন্সিং পদ্ধতির বিবরণ দেয় যা একই সাথে হাসপাতালের সমস্ত সাধারণ সংক্রমণকে ক্যাপচার করতে পারে৷ বর্তমান পদ্ধতিগুলি পৃথকভাবে সমস্ত রোগজীবাণুকে চাষ এবং ক্রমানুসারে তৈরি করে, যার জন্য বেশি সময় লাগে এবং আরও কাজ করতে হয়।

আজ (20 আগস্ট) প্রকাশিত হয়েছে ল্যানসেট মাইক্রোবায়োলজিগবেষণাটি 2020 সালে COVID-19 মহামারীর প্রথম তরঙ্গের সময় একাধিক হাসপাতালের নিবিড় পরিচর্যা ইউনিট (ICUs) এবং সাধারণ ওয়ার্ডগুলিতে পাওয়া প্যাথোজেনিক ব্যাকটেরিয়াগুলির সম্পূর্ণ বর্ণালী ক্যাপচার করেছে। গবেষকরা দেখতে পাচ্ছেন রোগীরা কী ধরনের ব্যাকটেরিয়া বহন করে, যার মধ্যে হাসপাতালে পাওয়া যে কোনো সুপরিচিত অ্যান্টিবায়োটিক-প্রতিরোধী প্যাথোজেন রয়েছে।

তারা দেখেছে যে গবেষণায় পরীক্ষিত প্রতিটি আইসিইউ রোগী এই ওষুধ-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়াগুলির মধ্যে অন্তত একটি দ্বারা উপনিবেশিত হয়েছিল এবং বেশিরভাগ রোগী একই সময়ে তাদের বেশ কয়েকটি দ্বারা উপনিবেশিত হয়েছিল।

গবেষকরা বিশ্বাস করেন যে তাদের পদ্ধতি বিদ্যমান হাসপাতালের ক্লিনিকাল মনিটরিং সিস্টেমের সাথে একত্রিত হতে পারে। যেহেতু ওষুধ প্রতিরোধ হাসপাতাল এবং অন্যান্য ক্লিনিকাল সেটিংসে একটি প্রচলিত সমস্যা, এই সিস্টেমটি একই সাথে সাধারণ মাল্টিড্রাগ-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়ার বিস্তারকে চিহ্নিত করতে, ট্র্যাক করতে এবং সীমিত করতে পারে।

ব্যাকটেরিয়া প্রায়ই ক্ষতি না করে শরীরে বা তার উপর বাস করে, যাকে বলা হয় উপনিবেশ। যাইহোক, যদি দুর্বল প্রতিরোধ ব্যবস্থার কারণে নির্দিষ্ট স্ট্রেনগুলি রক্ত ​​​​প্রবাহে প্রবেশ করে, তবে এন্টিবায়োটিকের সাথে কার্যকরভাবে চিকিত্সা করা না হলে তারা গুরুতর এবং জীবন-হুমকির সংক্রমণ ঘটাতে পারে।

এই ব্যাকটেরিয়াগুলির মধ্যে কিছু অ্যান্টিবায়োটিক প্রতিরোধী (AMR), যা স্বাস্থ্যসেবা প্রদানকারীদের জন্য একটি অতিরিক্ত চ্যালেঞ্জ উপস্থাপন করে। এএমআর ব্যাকটেরিয়া দ্বারা সৃষ্ট সংক্রমণ হাসপাতালের একটি প্রধান সমস্যা, এবং এই ওষুধ-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া 2050 সালের মধ্যে ক্যান্সারের চেয়ে বেশি লোককে হত্যা করবে বলে আশা করা হচ্ছে1. যদিও কিছু হাসপাতাল আগমনের পরে অ্যান্টিমাইক্রোবিয়াল-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া পরীক্ষা করে, এমন কোনও ব্যবস্থা নেই যা কার্যকরভাবে সমস্ত হাসপাতালের সমস্ত মাল্টিড্রাগ-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া ট্র্যাক করে।

বিগত 15 বছরে, জিনোমিক নজরদারি প্যাথোজেনগুলির বিবর্তন এবং বিস্তার ট্র্যাক করার জন্য একটি শক্তিশালী হাতিয়ার হয়ে উঠেছে, যা রোগের বিস্তার পরিচালনা করতে সাহায্য করার জন্য গুরুত্বপূর্ণ অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।

যাইহোক, বর্তমান পদ্ধতিগুলির মধ্যে একটি নমুনায় একবার একটি একক ব্যাকটেরিয়ার স্ট্রেন চাষ করা এবং তারপরে সমস্ত ব্যাকটেরিয়ার সম্পূর্ণ-জিনোম সিকোয়েন্সিং জড়িত। এটি একটি শ্রম-নিবিড় প্রক্রিয়া যা সহজেই বেশ কয়েক দিন সময় নিতে পারে এবং একটি নমুনায় পাওয়া সমস্ত চিকিত্সাগতভাবে প্রাসঙ্গিক ব্যাকটেরিয়াগুলির শুধুমাত্র একটি আংশিক স্ন্যাপশট প্রদান করে।

ওয়েলকাম স্যাঞ্জার ইনস্টিটিউট, অসলো বিশ্ববিদ্যালয়, ইতালির IRCCS পলিক্লিনিকো সান ম্যাটিও ফাউন্ডেশন এবং তাদের সহযোগীদের এই নতুন গবেষণায়, দলটি একটি নতুন পদ্ধতি তৈরি করেছে যা একসাথে একাধিক প্যাথোজেনের জন্য সম্পূর্ণ-জিনোম সিকোয়েন্সিং ডেটা ক্যাপচার করতে পারে। একটি “প্যান-প্যাথোজেন” গভীর সিকোয়েন্সিং পদ্ধতি হিসাবে পরিচিত, এই পদ্ধতিটি একটি হাসপাতাল যত তাড়াতাড়ি নমুনাগুলি প্রক্রিয়া করতে পারে তত দ্রুত জিনোমিক ডেটা সরবরাহ করতে পারে।

গবেষণা দলটি ইতালির একটি হাসপাতালে 256 জন রোগীর কাছ থেকে নমুনা সংগ্রহ করে, অন্ত্রে, উপরের শ্বাসযন্ত্রের ট্র্যাক্ট এবং ফুসফুসে পাওয়া ব্যাকটেরিয়া ক্যাপচার করে। 2,418 ডিএনএ নমুনা সম্ভাব্যভাবে 52 ব্যাকটেরিয়া প্রজাতির সাথে যুক্ত ছিল। এর মধ্যে 66% (2,148 ক্ষেত্রে) হাসপাতালে সাতটি সবচেয়ে সাধারণ ব্যাকটেরিয়া সংক্রমণের বিভিন্ন স্ট্রেন নিয়ে গঠিত।

তারা দেখেছে যে আইসিইউ রোগীদের অন্তত এক ধরণের ব্যাকটেরিয়া দ্বারা উপনিবেশ করা হয়েছিল যা যে কোনও সময় গুরুতর অসুস্থতার কারণ হতে পারে এবং তাদের মধ্যে অন্তত 40% ক্লিনিক্যালি উল্লেখযোগ্য AMR জিন ছিল।

দলটি কার্যকরভাবে 5-সপ্তাহের নমুনা নেওয়ার সময়কালে হাসপাতালের ব্যাকটেরিয়ার বিস্তারকে ম্যাপ করেছে, যা তাদের ভবিষ্যদ্বাণী করতে দেয় যে হাসপাতালের সংক্রমণে কোন ব্যাকটেরিয়া সবচেয়ে বেশি উপস্থিত হতে পারে।

একাধিক ব্যাকটেরিয়াল স্ট্রেন থেকে জেনেটিক তথ্য ক্যাপচার করার আমাদের পদ্ধতিতে একই সাথে প্যাথোজেনের জিনোমিক নজরদারি রূপান্তর করার সম্ভাবনা রয়েছে, যা আমাদেরকে রেজোলিউশন না হারিয়ে আগের চেয়ে দ্রুত এবং আরও ব্যাপকভাবে গুরুত্বপূর্ণ তথ্য ক্যাপচার করতে দেয়। আমাদের ধারণার প্রমাণ-অধ্যয়নের মাধ্যমে, এই পদ্ধতিটি এখন ভবিষ্যতের গবেষণায় আত্মবিশ্বাসের সাথে ব্যবহার করা যেতে পারে একটি এলাকায় সমস্ত উচ্চ-ঝুঁকির ব্যাকটেরিয়া ক্যাপচার করতে, এই আশায় যে হাসপাতালগুলি ড্রাগ-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়ার বিস্তার ট্র্যাক এবং সীমিত করতে সহায়তা করতে পারে।


প্রফেসর জুক্কা কোরান্ডার, ওয়েলকাম স্যাঞ্জার ইনস্টিটিউট এবং অসলো বিশ্ববিদ্যালয়ের সহ-সিনিয়র লেখক

প্রথম লেখক ডঃ হ্যারি থর্প, অসলো বিশ্ববিদ্যালয়ের ওয়েলকাম স্যাঞ্জার ইনস্টিটিউটের একজন পরিদর্শনকারী পণ্ডিত, বলেছেন: “আমাদের গবেষণাটি একটি উদাহরণ যে আমরা কীভাবে অ্যান্টিবায়োটিক-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া সম্পর্কে ব্যাপক বোঝার জন্য জিনোমিক্সের শক্তিকে কাজে লাগাতে পারি। যত্ন। ইউনিট এবং অ্যান্টিবায়োটিক-প্রতিরোধী ব্যাকটেরিয়া বিকশিত হয় এবং হাসপাতালের অন্যত্র দ্রুত ছড়িয়ে পড়ে, তাই আমাদের ট্র্যাকিং পদ্ধতিগুলি অবশ্যই তাদের সাথে তাল মিলিয়ে চলতে হবে এবং একটি নমুনায় সমস্ত ব্যাকটেরিয়ার অনুক্রম জানা থাকলে একটি নমুনায় পাওয়া বৈচিত্র্যের আরও সম্পূর্ণ চিত্র প্রদান করতে পারে, যা ঝুঁকির পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য এবং নির্দিষ্ট স্ট্রেনের বিস্তারের সাথে জড়িত বাহ্যিক কারণগুলি বোঝার জন্য দরকারী।

ফন্ডাজিওন আইআরসিসিএস পলিক্লিনিকো সান মাত্তেওর মাইক্রোবায়োলজি এবং ভাইরোলজি বিভাগের পরিচালক অধ্যাপক ফাস্টো বালদান্তি বলেছেন: “পশ্চিম বিশ্বে COVID-19-এর প্রথম কেস শনাক্ত হওয়ার সাথে সাথে, আমাদের বিভাগ এই মহামারী এবং বিশ্বের অগ্রগতির ভোরের সাক্ষী হয়েছে। এটার বিরুদ্ধে যুদ্ধে গুরুত্বপূর্ণ বৈজ্ঞানিক প্রচেষ্টা ছিল।

ওয়েলকাম স্যাঞ্জার ইনস্টিটিউটের সহ-সিনিয়র লেখক অধ্যাপক নিকোলাস থমসন বলেছেন: “অ্যান্টিবায়োটিক-প্রতিরোধী সংক্রমণ হাসপাতালগুলিতে একটি চলমান সমস্যা, এবং স্বাস্থ্যসেবা পেশাদাররা যতটা সম্ভব এই সংক্রমণগুলি কমাতে চেষ্টা করে, কিছু কিছুর বিরুদ্ধে লড়াই করা কঠিন। আপনি হাসপাতালের সমস্ত রোগীদের, বিশেষ করে নিবিড় পরিচর্যা ইউনিটে ওষুধ-প্রতিরোধী সংক্রমণের ঝুঁকি পরিচালনার জন্য নির্দেশিকা।

উৎস:

জার্নাল রেফারেন্স:

থর্প, এইচএ, ইত্যাদি (2024) 2020 সালের বসন্তে ইতালীয় হাসপাতালে ব্যাকটেরিয়া প্যাথোজেনগুলির প্যান-প্যাথোজেন গভীর অনুক্রম: একটি সম্ভাব্য সমগোত্রীয় গবেষণা. ল্যানসেট মাইক্রোবায়োলজি. doi.org/10.1016/S2666-5247(24)00113-7.

উৎস লিঙ্ক