Study: Exploratory multi-omics analysis reveals host-microbe interactions associated with disease severity in psoriatic skin. Image Credit: wisely/Shutterstock.com

সম্প্রতি প্রকাশিত একটি গবেষণা ইলেকট্রনিক বায়োমেডিসিন সোরিয়াসিসে হোস্ট-মাইক্রোব মিথস্ক্রিয়াগুলির একটি মাল্টি-ওমিক বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।

অধ্যয়ন: অনুসন্ধানমূলক মাল্টি-ওমিক্স বিশ্লেষণ প্রকাশ করে যে হোস্ট-মাইক্রোব মিথস্ক্রিয়া সোরিয়াটিক ত্বকের রোগের তীব্রতার সাথে সম্পর্কযুক্তইমেজ সোর্স: correctly/Shutterstock.com

পটভূমি

সোরিয়াসিস একটি সাধারণ পদ্ধতিগত প্রদাহজনিত রোগ যা বিশ্ব জনসংখ্যার 3% পর্যন্ত প্রভাবিত করে। এটি ডায়াবেটিস, সোরিয়াটিক আর্থ্রাইটিস এবং কার্ডিওভাসকুলার রোগের মতো জটিলতা সৃষ্টি করতে পারে।

রোগের বৈশিষ্ট্যের উপর ভিত্তি করে সোরিয়াসিসকে চিকিৎসাগতভাবে একাধিক উপপ্রকারে ভাগ করা যায়। বিভিন্ন কারণ যেমন এপিডার্মাল বাধা, পরিবেশগত কারণ এবং ইমিউন সিস্টেম সোরিয়াসিসের সংঘটন এবং বিকাশের সাথে সম্পর্কিত।

সোরিয়াসিসের একটি সুস্পষ্ট চিকিত্সার অভাব রয়েছে এবং এটি একটি উল্লেখযোগ্য মানসিক এবং আর্থিক বোঝা রয়ে গেছে। সোরিয়াটিক ত্বকের মাইক্রোবায়োটার গঠন এবং বৈচিত্র্য সুস্থ ত্বকের তুলনায় পরিবর্তিত হয়।

হোস্ট-মাইক্রোব মিথস্ক্রিয়া সোরিয়াসিসের বিকাশে জড়িত বলে মনে করা হয়। তদুপরি, সোরিয়াসিস রোগীদের মধ্যে ত্বকের মাইক্রোবায়োটা ডিসবায়োসিস রিপোর্ট করা হয়েছে, তবে মাইক্রোবায়োটা এবং হোস্টের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া অধ্যয়নের জন্য মাল্টিলেয়ার ওমিক্স ডেটার ব্যবহার অপর্যাপ্ত।

গবেষণা সম্পর্কে

এই গবেষণায়, গবেষকরা সোরিয়াসিসে হোস্ট-মাইক্রোব মিথস্ক্রিয়াগুলির একটি মাল্টি-ওমিক্স বিশ্লেষণ করেছেন। তারা স্কিন অ্যালার্জি এবং অটোইমিউনিটি (MAARS) কোহর্টের সাথে যুক্ত মাইক্রোঅর্গানিজমের ডেটা ব্যবহার করেছে।

প্লেক সোরিয়াসিস রোগী এবং সুস্থ স্বেচ্ছাসেবকদের নিয়োগ করা হয়েছিল। অটোইমিউন রোগে আক্রান্ত ব্যক্তিদের, অ্যান্টিবায়োটিকের সাম্প্রতিক ব্যবহার, ফটোথেরাপি, জীববিজ্ঞান বা ইমিউনোসপ্রেসিভ থেরাপি বাদ দেওয়া হয়েছিল।

স্কিন বায়োপসি এবং মাইক্রোবায়োম নমুনাগুলি সোরিয়াসিস রোগীদের নীচের পিঠে সক্রিয় ক্ষত সাইট এবং সংলগ্ন অ-ক্ষত অঞ্চল থেকে প্রাপ্ত হয়েছিল। সংশ্লিষ্ট এলাকার নমুনা সুস্থ ব্যক্তিদের কাছ থেকে নেওয়া হয়েছিল।

সমস্ত বিষয় একটি শারীরিক পরীক্ষা এবং একটি মেডিকেল ইতিহাস প্রাপ্ত করা হয়েছে. শটগান মেটাজেনমিক সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য মাইক্রোবায়োম নমুনা থেকে ডিএনএ বের করা হয়েছিল এবং ট্রান্সক্রিপশনাল বিশ্লেষণের জন্য বায়োপসি নমুনা থেকে আরএনএ আলাদা করা হয়েছিল।

ওয়েটেড জিন পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ (WGCNA) জিন এক্সপ্রেশন ডেটা ব্যবহার করে সম্পাদিত হয়েছিল। মাইক্রোবায়োমের কার্যকরী এবং শ্রেণীবিন্যাস বৈশিষ্ট্য নির্ধারণের জন্য পুরো-জিনোম শটগান সিকোয়েন্সিং করা হয়েছিল।

গ্রুপের মধ্যে তুলনা মান-হুইটনি এবং ক্রুস্কাল-ওয়ালিস পরীক্ষা ব্যবহার করে সঞ্চালিত হয়েছিল। স্পিয়ারম্যান পারস্পরিক সম্পর্ক অনুমান করা হয়েছিল এবং বয়স এবং লিঙ্গের জন্য সামঞ্জস্য করা হয়েছিল। ফেনোটাইপ এবং মাইক্রোবায়োটার মধ্যে মাল্টিভেরিয়েট অ্যাসোসিয়েশনের বিশ্লেষণ।

আবিষ্কার করুন

মোট 116 জন সোরিয়াসিস রোগী এবং 102 জন সুস্থ ব্যক্তি অন্তর্ভুক্ত ছিল। সোরিয়াসিস ক্ষতগুলির ত্বকের ট্রান্সক্রিপ্টোম নন-লেসন সোরিয়াসিস নমুনাগুলির থেকে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা। WGCNA জিন অন্টোলজি (GO) পদের সাথে টীকাযুক্ত ছয়টি মডিউল চিহ্নিত করেছে।

এছাড়াও পড়ুন  নতুন এআই টুল ক্লিনিকাল ট্রায়ালের দক্ষতা এবং খরচে বৈপ্লবিক পরিবর্তন আনতে পারে

একটি মডিউল ইতিবাচকভাবে সোরিয়াসিস এরিয়া এবং তীব্রতা সূচক (PASI) স্কোরের সাথে যুক্ত ছিল এবং প্রদাহ-সম্পর্কিত পথগুলিতে সমৃদ্ধ হয়েছিল।

PASI স্কোর এবং হোস্ট জিনের মধ্যে স্পিয়ারম্যান পারস্পরিক সম্পর্ক ক্ষত গ্রুপ এবং নন-লেসন গ্রুপের জন্য আলাদাভাবে মূল্যায়ন করা হয়েছিল।

এটি উভয় গ্রুপে অ্যান্টিভাইরাল প্রতিক্রিয়া সম্পর্কিত ফাংশন প্রকাশ করেছে। উভয় গ্রুপের প্রোটিন-প্রোটিন ইন্টারঅ্যাকশন (পিপিআই) নেটওয়ার্কে ইন্টারফেরন (আইএফএন) সম্পর্কিত নেটওয়ার্ক পাওয়া গেছে।

অতিরিক্তভাবে, সোরিয়াসিস-সম্পর্কিত সেলুলার পরিবর্তনগুলি সনাক্ত করতে একটি লিউকোসাইট ডিকনভোলিউশন অ্যালগরিদম ব্যবহার করা হয়েছিল। অ্যালগরিদম সুস্থ এবং অ-ক্ষতবিহীন সোরিয়াটিক ত্বকের তুলনায় রোগাক্রান্ত ত্বকের কোষের ভগ্নাংশে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য প্রকাশ করেছে।

এটি মনোসাইট, এন্ডোথেলিয়াল কোষ, পার্থক্য 4 (CD4) এর ক্লাস্টার বৃদ্ধির পূর্বাভাস দেয় টি কোষরোগাক্রান্ত ত্বকে কেরাটিনোসাইট এবং প্লাজমাসাইটয়েড ডেনড্রাইটিক কোষ, সেইসাথে ফাইব্রোব্লাস্ট, সাবকুটেনিয়াস অ্যাডিপোসাইট এবং অ্যাডিপোজ স্টেম কোষের হ্রাস।

উপরন্তু, 13টি অণুজীবকে হালকা, মাঝারি এবং গুরুতর PASI বিভাগে সমৃদ্ধ করা হয়েছিল। এর মধ্যে 11 টি সোরিয়াটিক ক্ষতগুলির সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে যুক্ত ছিল।

প্রচুর কোরিনেব্যাকটেরিয়াম ক্ষত এবং অ-ক্ষত উভয় গ্রুপেই PASI এর মাঝারি এবং গুরুতর বিভাগে প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়া উন্নত করা হয়েছিল।

যাহোক, ব্রণ ব্যাকটেরিয়া সুস্থ ত্বকের তুলনায় সোরিয়াটিক ত্বকে কম সাধারণ।উভয়ের মধ্যে একটি ইতিবাচক সম্পর্ক রয়েছে ক্যান্ডিডা সিউডোমোনাস এবং CD4 T কোষ, ডেনড্রাইটিক কোষ এবং কেরাটিনোসাইটের প্রাচুর্য। অতিরিক্তভাবে, দলটি সোরিয়াসিসে ত্বকের মাইক্রোবায়োম এবং ত্বকের জিনের প্রকাশের মধ্যে একটি উল্লেখযোগ্য মিথস্ক্রিয়া খুঁজে পেয়েছে।

বিশেষ করে, ব্রণ ব্যাকটেরিয়া এবং ক্যান্ডিডা সিউডোমোনাস বিভিন্ন হোস্ট জিন, বিশেষ করে IFN-ইনডিউসিবল জিন যেমন IFI27 এবং IFIH1 এর অভিব্যক্তির সাথে উল্লেখযোগ্য পারস্পরিক সম্পর্ক দেখিয়েছে।

এছাড়াও, সোরিয়াটিক ক্ষত এবং অ-ক্ষতজনিত এবং স্বাস্থ্যকর ত্বকের মধ্যে মাইক্রোবায়োটার কার্যকরী বৈশিষ্ট্যের মধ্যে উল্লেখযোগ্য পার্থক্য ছিল মাইক্রোবিয়াল জিন পরিবারের হায়ারার্কিক্যাল ক্লাস্টারিং বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে সোরিয়াটিক ক্ষত গ্রুপে দুটি আলাদা ক্লাস্টার ছিল।

Micrococcus luteus সুস্থ বা ক্ষতবিহীন সোরিয়াটিক ত্বকের তুলনায় সোরিয়াটিক ক্ষতগুলিতে কম সোরিয়াটিক ক্ষত রয়েছে এবং ক্লাস্টার 2 এর তুলনায় কম ক্লাস্টার 1 আছে।

মাইক্রোবিয়াল বিপাকীয় পথের অভিব্যক্তি (বায়ুবিক শ্বসন I ব্যতীত) ক্লাস্টার 1-এ কম ছিল, যখন ইন্টারলেউকিন (IL)-19 এবং IL-36A-এর মতো হোস্ট জিনের অভিব্যক্তি আপ-নিয়ন্ত্রিত ছিল। ক্লাস্টার 1 লিপোপলিস্যাকারাইড প্রতিক্রিয়া এবং জৈবিক উদ্দীপনার সেলুলার প্রতিক্রিয়া সম্পর্কিত পথগুলিতে সমৃদ্ধ।

উপসংহারে

এই গবেষণাটি সোরিয়াসিসে হোস্ট জিন এবং মাইক্রোবিয়াল স্বাক্ষরের মধ্যে সম্পর্ক তদন্ত করেছে।গবেষণা ফলাফল দেখায় যে অ্যান্টিভাইরাল প্রতিক্রিয়া সম্পর্কিত ক্যান্ডিডা সিউডোমোনাস সোরিয়াসিস হওয়ার তীব্রতা।

স্বতন্ত্র হোস্ট এবং মাইক্রোবিয়াল বৈশিষ্ট্য সহ দুটি সোরিয়াসিস ক্লাস্টার সনাক্ত করা হয়েছিল। অধিকন্তু, ফলাফলগুলি পরামর্শ দেয় যে একযোগে মাইক্রোবায়োটা মডুলেশন এবং ইমিউনোমোডুলেটরি থেরাপি সোরিয়াসিস রোগীদের জন্য উপকারী হতে পারে।

উৎস লিঙ্ক